昆虫病毒学研究组针对农林重大害虫，利用昆虫生理学、病理学、生物化学和分子生物学的方法和手段，围绕害虫的天敌和病原展开基础性和应用性的研究，寻求对环境安全的害虫可持续控制的新方法和新途径。研究组在研项目包括农业行业公益性专项、中科院创新重要方向项目、国家863项目、横向课题等。利用研究组昆虫病毒的研发成果，动物所于2003年开始同河南省济源白云实业有限公司合作，研发生产昆虫病毒生物农药，成为我国产能最大的昆虫病毒生物农药研发和生产基地，并于2006年5月经全国博士后管委会批准建立了博士后科研工作站。技术成果转化已获得病毒生物农药登记证8个，申报专利10多项。研究组拥有完善的科研平台，同时配备了昆虫细胞培养室和养虫室。目前科研队伍共10人，其中工作人员6人、研究生3名、博士后1名。
　　研究组组长：秦启联，男，1967年10月出生，博士，研究员，昆虫病毒学研究组组长，中国昆虫学会第七届、第八届理事。1990年江苏农学院本科毕业，1999年获中国科学院动物研究所理学博士学位。1999年至今，在中国科学院动物研究所工作，主要从事昆虫病毒杀虫剂产业化研发和害虫生物防治，同时进行昆虫病毒学和昆虫生理生化研究。发表学术论文40余篇，申请专利10余项，技术成果鉴定4项。任职以来，主持或参加自然科学基金、863、948、国家支撑计划、农业公益性行业科研专项、科学院创新重要方向项目、技术开发、技术转让等项目10多项。